Hokkaido est vaste — environ 500 km d'est en ouest — et les transports en commun, suffisants pour relier les grandes villes, ne permettent pas d'explorer la nature sans voiture.
Depuis Sapporo, le réseau JR Hokkaido dessert les axes principaux : Hakodate (3h en Shinkansen depuis 2016), Asahikawa (1h30 en Limited Express), Otaru (30 min), Niseko (2h par l'express Niseko à saisonnalité limitée). La plupart de ces liaisons sont couvertes par le Japan Rail Pass. En revanche, Furano (2h15 depuis Sapporo par l'express Furano-Lavender Express, saisonnier), Shiretoko (6h depuis Sapporo, navette depuis Abashiri) et la plupart des parcs nationaux sont nettement plus commodes en voiture.
La location de voiture est fortement recommandée pour tout circuit de plus de 3 jours hors Sapporo. Toutes les grandes agences (Toyota, Nissan, Times) sont représentées à l'aéroport de Chitose. En hiver, exigez systématiquement des pneus neige (studded ou all-season) et vérifiez les conditions de route avant de partir — les routes nationales sont dégagées rapidement, mais les petites routes de montagne peuvent être fermées après une grosse chute de neige.
À Sapporo même, le réseau de métro (3 lignes), le tramway et les bus suffisent pour tous les déplacements intra-urbains. La carte Sapica (équivalent de la Suica) est rechargeable et valable sur tous les réseaux.
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