La ville haute (Citadelle) se visite en 2-3 heures à pied. Incontournables : Bastion de l'Étendard (vue panoramique sur les falaises et la Sardaigne), Porte de Gênes (entrée principale avec pont-levis), nécropole de Saint-Antoine (sépultures médiévales taillées dans la falaise), escalier du Roi d'Aragon (187 marches taillées dans la falaise calcaire, 70 m de descente jusqu'à la mer, accès payant 3 €), église Sainte-Marie Majeure (XIIe-XVIe siècles, citerne médiévale de 650 m³), Maison du Podestat (musée). Promenade sur les remparts gratuits.
Le port (en contrebas dans la crique naturelle) accueille yachts, bateaux de croisière, restaurants en terrasse. Animation maximale en soirée. Croisières incontournables : grottes marines depuis le port (1h30, 25-35 €/personne — grotte du Sdragonatu avec son ouverture en "chapeau de Napoléon", grotte Saint-Antoine, calanques rocheuses), îles Lavezzi (40-55 €/personne A/R, journée complète, snorkeling, plages paradisiaques).
Les plages autour de Bonifacio : Saint-Antoine (à pied depuis la ville, sauvage), Cala Longa (5 km, sable blanc), Piantarella (10 km, kitesurf, vue sur Lavezzi), Sperone (8 km, chic, golf), Tonnara (12 km, vagues fortes). Au-delà (à 30-45 min en voiture) : Palombaggia (la plus iconique de Corse, sable blanc + pins parasol), Santa Giulia (baie turquoise protégée), Rondinara (coquillage parfait).
Les excursions : Sardaigne via ferry Bonifacio-Santa Teresa Gallura (1h, 30-50 €/personne A/R) — possibilité de journée ou plusieurs jours (Costa Smeralda à 50 min). Sartène (45 min, la "plus corse des villes corses" selon Mérimée, ruelles médiévales austères en granit). Aiguilles de Bavella (1h, route D268 spectaculaire, randonnée trou de la Bombe). Porto-Vecchio (30 min, vieille ville fortifiée, port animé, base pour Palombaggia).