L'Andalousie est bien desservie en train pour les grandes villes mais nécessite une voiture pour les zones rurales. Le réseau AVE et Avant (train à grande vitesse) relie Madrid à Séville en 2h20 et à Málaga en 2h20. Séville et Málaga sont reliées entre elles en 2h. Cordoue est sur le trajet Madrid-Séville (45 min depuis Séville, 55 min depuis Madrid). Grenade n'est pas desservie par l'AVE depuis Madrid — le plus pratique est le bus Alsa (3h30 depuis Séville, 3h depuis Málaga, 5h depuis Madrid).
À l'intérieur de la région, le réseau de bus Alsa et Comes relie efficacement les principales villes et les villages touristiques, mais les fréquences diminuent dans les zones rurales. Pour les Pueblos blancos, la Sierra de Grazalema, la Sierra Nevada ou la Costa de Almería, la voiture de location est indispensable. Les routes andalouses sont généralement en bon état mais sinueuses dans les reliefs — comptez le double du temps par rapport aux distances à vol d'oiseau.
À Séville, le tramway (ligne 1, Cavalerie-Prado de San Sebastián) et le bus urbain couvrent efficacement le centre-ville. Le vélo est une option intéressante pour les distances intra-muros — service de vélos en libre-service SEVICI disponible. De nombreux sites du centre historique sont à pied les uns des autres.
Les principaux aéroports internationaux sont Málaga-Costa del Sol (AGP, le plus fréquenté, hub Ryanair et EasyJet), Séville (SVQ, vols directs depuis Paris) et Grenade (GRX, quelques vols low-cost). L'aéroport de Jerez de la Frontera (XRY) dessert la Costa de la Luz.
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