La voiture reste le moyen de transport le plus pratique pour explorer l'Algarve, particulièrement pour accéder aux plages et criques hors des grandes stations. La Via do Infante (A22) traverse la région d'est en ouest en péage ; l'EN125 nationale est plus lente mais dessert tous les villages côtiers.
Le train (Comboios de Portugal) relie Faro à Lagos à l'ouest et à Vila Real de Santo António à l'est, avec des départs toutes les heures environ. Depuis Lisbonne, le train Alfa Pendular atteint Faro en 2h45 (environ 25-35 € l'aller). Lagos est à 3h30 de Lisbonne en train direct. Ces connexions ferroviaires permettent de visiter l'Algarve sans voiture si l'on reste dans les grandes villes, mais les plages les plus remarquables restent difficiles à atteindre par ce seul moyen.
Depuis les principales villes, des navettes en bateau desservent certaines plages et îles (Meia Praia depuis Lagos, îles de la Ria Formosa depuis Faro et Olhão). Les vélos et scooters se louent facilement dans les grandes stations pour les déplacements côtiers sur courte distance.
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