La région est bien desservie depuis les grandes villes marocaines. Fès possède son propre aéroport international (Fès-Saïss), avec des vols directs depuis Paris, Lyon, Bruxelles et plusieurs autres villes européennes. Meknès, sans aéroport propre, se rejoint facilement en train ou en taxi depuis Fès. L'arrivée par le réseau ferroviaire ONCF est également pratique : Fès est reliée à Casablanca en environ 3h30, à Tanger en 3 heures, et les trains sont confortables et ponctuels.
Le train entre Fès et Meknès est l'option la plus commode pour relier les deux villes impériales : le trajet dure une quarantaine de minutes et les départs sont fréquents tout au long de la journée. Pour Volubilis et Moulay Idriss, aucune ligne ferroviaire ne dessert ces sites ; il faut opter pour un grand taxi collectif depuis Meknès (environ 30 minutes jusqu'à Moulay Idriss), une excursion organisée au départ de Fès, ou louer une voiture pour plus de liberté. La location de voiture est d'ailleurs conseillée si l'on souhaite explorer le Moyen Atlas, les alentours d'Ifrane ou les villages berbères isolés de la région.
À l'intérieur des médinas de Fès et de Meknès, tout se fait à pied. Les véhicules motorisés sont interdits dans une grande partie de la médina de Fès el-Bali, et les ruelles sinueuses ne laissent de toute façon pas la place. Un guide local agréé, pour la première journée à Fès, permet de gagner du temps et d'éviter les pièges des faux guides. Des calèches et des petits taxis (rouges à Fès, bleus à Meknès) assurent les liaisons entre les quartiers et la ville nouvelle. Pour les excursions à la journée — Volubilis, Moulay Idriss, voire Ifrane ou Azrou — les agences locales proposent des formules clés en main très accessibles.
En définitive, circuler dans la région Fès-Meknès demande peu d'organisation : le triangle Fès-Meknès-Volubilis se parcourt aisément en deux à trois jours, en combinant train, grand taxi et excursion. La voiture de location ne devient vraiment utile que pour rayonner vers le Moyen Atlas ou les villages les plus reculés. Pour qui préfère voyager l'esprit libre, confier la logistique à un chauffeur-guide local reste la solution la plus confortable, et souvent la plus instructive.
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